La colección inició con los libros productos de las investigaciones de los profesores y para atender las necesidades de información de los estudiantes del Posgrado Centroamericano en Historia que comprende dos maestrías presenciales y un doctorado y de una maestría bimodal. Entre ellos los libros de texto de Estudios Sociales de la Serie Hacia el Siglo XXI, Avances de Investigación del CIHAC, Serie Trabajos de Metodología, Actualidades del CIHAC, Colección de Historia de Costa Rica y Colección Historia de Centroamérica. Los investigadores Víctor Hugo Acuña, Juan Carlos Solórzano, Elizabeth Fonseca, Héctor Pérez, Rina Cáceres, entre otros, contribuyeron con la donación de libros de sus compilaciones personales. La colección general abarca gran cantidad de temas debido a la relación de la historia con las demás disciplinas. Así se encuentran temas como historia social, colonial, económica, ambiental, local, regional, cultural, política, religiosa, militar, marítima; historia de la educación, de la medicina, del deporte, del arte, de la población, de la moneda, del vestido, de la fotografía, de la música, del libro, demografía histórica, geografía histórica, novela histórica, arquitectura, etnología, población, genealogía, antropología, género y biografías.

Al ser un importante insumo para estudios sobre historia económica nacional, el archivo del Banco Central donó al CEDOCIHAC sus libros y documentos contables de carácter histórico.

Esta colección entró en el año 2012. Es una compilación de libros contables de carácter histórico. Es una colección abierta.

La colección Meléndez se constituyó en la mayor de las adquisiciones del CEDOCIHAC. Meléndez fue un gran coleccionista desde diversos ámbitos.  Su capacidad intelectual le condujo a escribir estudios acerca de varios temas históricos y a tener contactos con profesionales en todo el mundo hispánico, sobretodo en México y Centroamérica, también en Europa y Estados Unidos, por lo que su colección es vasta.

 La Colección Carlos Meléndez corresponde a una biblioteca especializada en vista de que abarca una gran diversidad de títulos de gran interés para los estudios históricos sobre Costa Rica y Centroamérica. El Dr. Meléndez utilizó su criterio profesional para determinar la agrupación de los libros en grandes secciones temáticas o regionales.  La categoría temática es la siguiente: historia, ciencias sociales, literatura, biografías, cultura, sociedad, geografía, religión, educación, arte, filosofía, arqueología, sociología y geología.

La distribución geográfica según cantidad de ejemplares es la siguiente: El área centroamericana abarca el 48% del total de la colección. El restante 52% se compone de libros de España, México el resto de América, así como contempla 110 libros sobre El Caribe,  98 sobre África, 45 sobre Asia,  321 sobre Europa y una categoría general con 2156 libros que atañen a cualquier país.

la Dra. Hall donó su colección personal al CEDOCIHAC con el fin de que se visibilizara, ya que posee materiales importados por ella desde Inglaterra su país natal.

La Colección Hall corresponde a una compilación de libros sobre los temas Historia y Geografía, Geografía Histórica y Construcción de caminos. Hizo su ingreso al Centro en el año 2005.

La colección Quirós llegó al CEDOCIHAC después del fallecimiento de la profesora, como un aporte de su familia con el fin de que sus investigaciones y los libros de su compilación personal, fueran de utilidad para los usuarios del Centro.

La temática de esta colección es historia colonial. Ingresó al Centro en el 2006. Además de libros la Colección Quirós cuenta un archivo que contiene correspondencia, avances de investigación, fotocopias de complementos coloniales e insumos para clases de neografía y paleografía.

Esta colección está en continuo crecimiento ya que se nutre constantemente de las nuevas donaciones de su compilador.

La Colección donada por Eduardo Fournier versa sobre temas generales de historia y archivística. Posee libros de importantes editoriales como el Fondo de Cultura Económica y autores destacados en el área de la historia en el ámbito internacional. Se han recibido dos partes de esa colección: la primera en el 2009 y la segunda en el 2011. Está abierta pues don Eduardo constantemente la amplía.

Por su marcado interés en la historia local y regional y sus múltiples escritos e investigaciones sobre el tema, don Francisco consideró que esa amplia variedad de fuentes de su colección debía permanecer en el CEDOCIHAC para su aprovechamiento.

La colección sobre historia local y regional donada por don Francisco Enríquez, se ha nutrido este año 2015 con la adición de 5 metros lineales de separatas, artículos, antologías, folletos y otros tipos de valiosos materiales que permitirán la investigación de distintas localidades costarricenses, permitiendo formar la historia específica de esos sitios y la exploración cultural de los mismos. Es una colección abierta en constante crecimiento.

Su permanencia en los Estados Unidos y la continuidad de sus estudios sobre Costa Rica y Centroamérica, le permitieron al Dr. Murillo percatarse de la importancia de que la compilación de sus libros fueran parte del acervo bibliográfico del CEDOCIHAC, por lo cual realizó su donación.

La donación de la colección académica del Dr. Hugo Murillo consta de libros y revistas que tratan temas de Historia e Historiografía como por ejemplo: Historia diplomática de América Latina, Historia de los Estados Unidos, Historia de América Central, Historia de México, Ciencias Políticas, Historia de Europa e Historia Diplomática general. La mayoría de los textos en idioma inglés. Es una colección abierta. Ingresó al Centro en el 2013.

Siendo Director del CIHAC por 2 períodos, el Dr. Marín observó el desarrollo de los distintos programas de investigación y sus necesidades de información, por lo que consideró oportuno donar su colección al Centro para enriquecer su acervo.

La colección del Dr. Juan José Marín consta de materiales sobre Historia social, historia de la marginalidad e historia regional. Es una colección abierta que tiene diversos tipos de materiales como libros, textos, referencia, tesis y separatas. La particularidad de esta colección radica en la actualidad de la misma, pues son insumos para los múltiples trabajos de investigación y finales de graduación de los estudiantes del posgrado en historia.

La familia del Dr. Menjivar había donado parte de su colección a la Biblioteca Eugenio Fonseca Tortós de la Facultad de Ciencias Sociales y decidió que la parte restante del área de historia, fuera trasladada al CEDOCIHAC.

La Colección Menjivar ingresó al CEDOCIHAC en el año 2005. Está compuesta por libros sobre  los temas: política y movimientos sociales.

Por su interés en los temas sobre al agro nacional e internacional, esta colección fue donada por el hijo de don Rogelio, quien consideró que es una fuente muy importante para estudios sobre Historia Ambiental en el ámbito costarricense. Consta de libros y publicaciones periódicas.